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PROV - PROW
UniProt: P14175 - P14176
Length: 754
Sequences: 527
Seq/Len: 0.79
I_Prob: 1.00

PROV - Glycine betaine/L-proline transport ATP-binding protein ProV
Paralog alert: 0.38 [within 20: 0.01] - ratio of genomes with paralogs
Cluster includes: ARTP BTUD CCMA CYSA DDPD DDPF DPPD DPPF FBPC FECE FEPC FHUC FTSE GLNQ GLTL HISP LIVF LIVG LOLD LPTB MALK METN MLAF MODC NIKD NIKE OPPD OPPF PHNC PHNK PHNL POTA POTG PROV PSTB SAPD SAPF SSUB SUFC TAUB THIQ UGPC YADG YBBA YBBL YCJV YDCT YECC YEHX YHDZ YNJD ZNUC
PROW - Glycine betaine/L-proline transport system permease protein ProW
Paralog alert: 0.15 [within 20: 0.03] - ratio of genomes with paralogs
Cluster includes: PROW
GREMLIN Results (Scaled_score > 1):

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher strength in coevolution. Blue filled circles are GREMLIN results (Scaled_score >1). The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment confidence. Inter-chain contacts in the pdb are in shades of red.
3rlfAB:F:GContact Map
3d31AB:CDContact Map
2onkABGF:CHDIContact Map


Residue pairs sorted by strength in coevolution signal:
i j Scaled Score I_Prob
129_F 246_A 3.23 1.00
132_E 254_K 1.95 0.85
97_D 248_P 1.41 0.43
191_A 284_M 1.40 0.42
53_E 243_S 1.36 0.38
279_I 171_A 1.34 0.37
143_E 179_I 1.32 0.35
120_H 259_L 1.32 0.34
221_I 211_V 1.29 0.32
144_K 112_V 1.26 0.29
219_V 329_R 1.25 0.28
133_L 246_A 1.24 0.27
231_I 86_V 1.18 0.22
208_V 261_M 1.17 0.21
206_E 234_P 1.16 0.21
391_A 63_P 1.15 0.20
244_V 159_C 1.11 0.18
185_I 119_Q 1.11 0.18
252_I 246_A 1.11 0.17
249_P 281_I 1.10 0.17
243_V 143_S 1.10 0.17
185_I 102_L 1.08 0.16
85_V 140_G 1.08 0.15
118_M 132_S 1.07 0.15
221_I 259_L 1.07 0.15
13_I 285_I 1.06 0.14
75_N 289_G 1.05 0.14
216_R 309_G 1.04 0.13
358_E 82_V 1.04 0.13
144_K 85_G 1.04 0.13
73_L 283_S 1.03 0.13
188_M 228_L 1.03 0.13
236_A 83_F 1.03 0.13
175_L 220_P 1.03 0.13
76_R 285_I 1.03 0.13
206_E 283_S 1.03 0.13
75_N 228_L 1.03 0.12
238_M 79_F 1.02 0.12
114_S 183_L 1.02 0.12
75_N 187_M 1.02 0.12
48_S 157_L 1.02 0.12
105_R 250_Q 1.02 0.12
140_E 161_V 1.02 0.12
107_K 241_S 1.01 0.12
48_S 124_G 1.01 0.11
125_D 112_V 1.01 0.11
269_D 275_A 1.00 0.11
188_M 266_A 1.00 0.11
136_I 259_L 1.00 0.11
9_N 161_V 1.00 0.11
144_K 88_V 0.99 0.11
188_M 165_P 0.99 0.10
120_H 221_P 0.99 0.10
202_E 164_L 0.98 0.10
239_Q 212_V 0.98 0.10
214_H 192_A 0.98 0.10
207_L 230_I 0.98 0.10
231_I 146_M 0.97 0.10
118_M 246_A 0.97 0.10
191_A 256_Q 0.97 0.10
229_M 286_A 0.96 0.09
37_K 178_K 0.96 0.09
133_L 160_I 0.96 0.09
184_D 213_V 0.96 0.09
149_L 192_A 0.96 0.09
75_N 165_P 0.95 0.09
44_V 83_F 0.95 0.09
93_A 127_V 0.95 0.09
73_L 83_F 0.95 0.09
301_K 166_L 0.95 0.09
71_V 211_V 0.95 0.09
188_M 289_G 0.94 0.09
116_A 320_L 0.94 0.09
216_R 125_M 0.94 0.09
253_L 324_T 0.94 0.08
75_N 244_F 0.93 0.08
132_E 199_I 0.93 0.08
178_A 314_V 0.93 0.08
78_I 264_I 0.93 0.08
57_F 200_V 0.93 0.08
356_L 255_V 0.92 0.08
331_T 238_I 0.92 0.08
123_V 275_A 0.92 0.08
16_E 113_F 0.92 0.08
249_P 163_G 0.92 0.08
130_G 220_P 0.92 0.08
219_V 113_F 0.92 0.08
258_N 210_G 0.92 0.08
271_S 284_M 0.92 0.08
203_M 259_L 0.91 0.07
123_V 218_A 0.91 0.07
251_E 313_I 0.91 0.07
270_I 300_R 0.91 0.07
185_I 115_L 0.91 0.07
271_S 268_V 0.91 0.07
385_K 97_F 0.91 0.07
128_A 282_A 0.91 0.07
96_S 126_G 0.91 0.07
157_Y 223_I 0.90 0.07
10_L 118_W 0.90 0.07
188_M 225_L 0.90 0.07
71_V 237_L 0.90 0.07
164_E 262_P 0.90 0.07
392_L 237_L 0.90 0.07
48_S 312_G 0.89 0.07
43_G 268_V 0.89 0.07
188_M 244_F 0.89 0.07
262_R 136_I 0.89 0.07
31_K 325_Q 0.88 0.07
150_R 216_I 0.88 0.06
47_A 122_G 0.88 0.06
136_I 116_I 0.88 0.06
230_R 259_L 0.88 0.06
208_V 136_I 0.88 0.06
243_V 176_A 0.88 0.06
157_Y 170_L 0.87 0.06
76_R 250_Q 0.87 0.06
203_M 256_Q 0.87 0.06
276_A 217_F 0.87 0.06
188_M 187_M 0.87 0.06
208_V 215_I 0.87 0.06
170_R 81_P 0.87 0.06
130_G 314_V 0.87 0.06
181_I 263_T 0.87 0.06
42_L 271_T 0.87 0.06
78_I 325_Q 0.87 0.06
157_Y 297_G 0.87 0.06
94_K 66_S 0.87 0.06
230_R 172_R 0.86 0.06
221_I 192_A 0.86 0.06
253_L 200_V 0.86 0.06
269_D 165_P 0.86 0.06
232_G 314_V 0.86 0.06
95_I 272_L 0.86 0.06
137_N 92_Y 0.86 0.06
82_R 108_V 0.86 0.06
188_M 314_V 0.86 0.06
40_L 223_I 0.86 0.06
26_E 166_L 0.85 0.06
15_G 247_S 0.85 0.06
129_F 302_D 0.85 0.06
207_L 244_F 0.85 0.06
134_A 219_L 0.85 0.06
170_R 164_L 0.85 0.06
139_E 93_I 0.85 0.06
11_Y 234_P 0.85 0.06
233_D 269_N 0.85 0.06
124_L 257_L 0.85 0.05
44_V 128_A 0.85 0.05
7_I 324_T 0.85 0.05
133_L 286_A 0.85 0.05
202_E 137_G 0.85 0.05
267_G 254_K 0.85 0.05
40_L 63_P 0.84 0.05
376_D 268_V 0.84 0.05
125_D 169_W 0.84 0.05
157_Y 309_G 0.84 0.05
232_G 228_L 0.84 0.05
129_F 234_P 0.84 0.05
247_G 313_I 0.84 0.05
186_L 280_V 0.84 0.05
232_G 225_L 0.83 0.05
368_C 298_I 0.83 0.05
383_I 319_I 0.83 0.05
109_A 210_G 0.83 0.05
188_M 243_S 0.83 0.05
57_F 283_S 0.83 0.05
55_E 234_P 0.83 0.05
187_L 266_A 0.83 0.05
187_L 225_L 0.83 0.05
31_K 295_L 0.83 0.05
382_I 110_I 0.83 0.05
221_I 200_V 0.83 0.05
87_I 246_A 0.83 0.05
226_D 225_L 0.83 0.05
133_L 190_T 0.83 0.05
150_R 183_L 0.83 0.05
38_T 204_G 0.82 0.05
162_P 236_D 0.82 0.05
109_A 240_A 0.82 0.05
313_V 219_L 0.82 0.05
78_I 297_G 0.82 0.05
277_K 79_F 0.82 0.05
73_L 259_L 0.82 0.05
75_N 225_L 0.82 0.05
75_N 266_A 0.82 0.05
178_A 184_L 0.82 0.05
226_D 279_V 0.82 0.05
136_I 180_I 0.82 0.05
46_D 155_A 0.82 0.05
222_S 299_G 0.82 0.05
249_P 313_I 0.82 0.05
236_A 298_I 0.82 0.05
148_A 232_Q 0.82 0.05
149_L 289_G 0.81 0.05
358_E 91_D 0.81 0.05
151_Q 295_L 0.81 0.05
157_Y 295_L 0.81 0.05
51_I 117_A 0.81 0.05
134_A 160_I 0.81 0.05
258_N 127_V 0.81 0.05
80_P 304_G 0.81 0.04
89_G 256_Q 0.81 0.04
202_E 297_G 0.81 0.04
118_M 255_V 0.81 0.04
221_I 154_T 0.81 0.04
279_I 280_V 0.81 0.04
211_Q 271_T 0.81 0.04
87_I 66_S 0.81 0.04
78_I 227_I 0.81 0.04
225_L 282_A 0.81 0.04
259_D 174_P 0.81 0.04
265_F 285_I 0.81 0.04
142_R 128_A 0.81 0.04
108_I 83_F 0.81 0.04
221_I 256_Q 0.81 0.04
236_A 145_A 0.81 0.04
219_V 124_G 0.81 0.04
92_I 82_V 0.81 0.04
21_A 83_F 0.81 0.04
5_L 139_I 0.80 0.04
125_D 213_V 0.80 0.04
243_V 83_F 0.80 0.04
362_H 135_A 0.80 0.04
51_I 170_L 0.80 0.04
253_L 192_A 0.80 0.04
258_N 96_G 0.80 0.04
206_E 287_V 0.80 0.04
40_L 237_L 0.80 0.04
366_A 112_V 0.80 0.04
28_G 243_S 0.80 0.04
388_L 265_M 0.80 0.04
236_A 201_M 0.80 0.04
96_S 125_M 0.80 0.04
191_A 325_Q 0.80 0.04
47_A 268_V 0.79 0.04
116_A 311_V 0.79 0.04
116_A 208_V 0.79 0.04
346_A 127_V 0.79 0.04
188_M 184_L 0.79 0.04
388_L 150_A 0.79 0.04
175_L 314_V 0.79 0.04
259_D 257_L 0.79 0.04
279_I 178_K 0.79 0.04
346_A 126_G 0.79 0.04
232_G 184_L 0.79 0.04
37_K 179_I 0.79 0.04
188_M 182_P 0.79 0.04
321_V 162_I 0.79 0.04
254_N 219_L 0.79 0.04
232_G 279_V 0.79 0.04
331_T 174_P 0.79 0.04
392_L 243_S 0.79 0.04
71_V 84_Q 0.79 0.04
346_A 101_L 0.79 0.04
188_M 214_T 0.79 0.04
321_V 161_V 0.79 0.04
186_L 314_V 0.79 0.04
129_F 218_A 0.79 0.04
20_R 116_I 0.79 0.04
81_T 247_S 0.78 0.04
244_V 313_I 0.78 0.04
258_N 115_L 0.78 0.04
4_K 284_M 0.78 0.04
91_D 78_H 0.78 0.04
89_G 161_V 0.78 0.04
252_I 282_A 0.78 0.04
178_A 204_G 0.78 0.04
52_E 164_L 0.78 0.04
130_G 230_I 0.78 0.04
254_N 115_L 0.78 0.04
138_A 123_V 0.78 0.04
116_A 236_D 0.78 0.04
187_L 280_V 0.78 0.04
163_D 257_L 0.78 0.04
257_A 271_T 0.78 0.04
269_D 217_F 0.78 0.04
149_L 187_M 0.78 0.04
253_L 190_T 0.78 0.04
392_L 248_P 0.78 0.04
47_A 108_V 0.77 0.04
75_N 314_V 0.77 0.04
86_L 62_I 0.77 0.04
49_L 181_R 0.77 0.04
125_D 205_I 0.77 0.04
55_E 217_F 0.77 0.04
258_N 100_L 0.77 0.04
209_K 210_G 0.77 0.04
41_S 190_T 0.77 0.04
145_A 325_Q 0.77 0.04
31_K 227_I 0.77 0.04
187_L 279_V 0.77 0.04
59_I 308_V 0.77 0.04
89_G 246_A 0.77 0.04
202_E 298_I 0.77 0.04
Legend: The i (protein A) and j (protein B) are positions as given in the UniProt sequences. The value of the raw score is the function of the learning procedure, L2 normalization and APC (entropic) correction.

Scaled Score = raw_score/average(raw_scores)
I_Prob = P(contact | scaled_score, seq/len, top_inter_score)

Text file of predictions
(includes both intra and inter preds)

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