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APPB - APPC
UniProt: P26458 - P26459
Length: 892
Sequences: 1033
Seq/Len: 1.21
I_Prob: 1.00

APPB - Cytochrome bd-II oxidase subunit 2
Paralog alert: 0.48 [within 20: 0.00] - ratio of genomes with paralogs
Cluster includes: APPB CYDB
APPC - Cytochrome bd-II oxidase subunit 1
Paralog alert: 0.45 [within 20: 0.00] - ratio of genomes with paralogs
Cluster includes: APPC CYDA
GREMLIN Results (Scaled_score > 1):

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher strength in coevolution.

Residue pairs sorted by strength in coevolution signal:
i j Scaled Score I_Prob
91_I 474_S 2.97 1.00
101_P 68_A 2.74 0.99
95_C 481_L 2.11 0.95
88_V 473_F 2.03 0.94
95_C 477_M 1.96 0.93
342_I 98_M 1.87 0.90
91_I 477_M 1.60 0.77
332_S 90_D 1.51 0.70
80_A 90_D 1.37 0.57
155_V 86_N 1.31 0.51
99_F 481_L 1.28 0.47
360_K 113_L 1.27 0.46
66_L 100_A 1.25 0.44
339_M 97_A 1.25 0.44
106_Y 489_E 1.25 0.43
356_W 113_L 1.17 0.35
88_V 474_S 1.13 0.32
54_G 485_F 1.12 0.31
199_R 123_K 1.08 0.27
338_I 170_S 1.07 0.26
191_K 71_L 1.06 0.25
65_I 71_L 1.05 0.24
104_F 102_M 1.04 0.23
59_G 72_T 1.03 0.23
330_T 165_R 1.03 0.22
73_A 97_A 1.02 0.22
291_F 137_S 1.02 0.22
69_G 97_A 1.02 0.21
66_L 108_S 1.01 0.21
332_S 219_S 0.98 0.19
270_L 240_S 0.98 0.18
364_R 245_V 0.97 0.18
346_F 102_M 0.96 0.17
360_K 125_Q 0.96 0.17
18_I 74_E 0.96 0.17
278_T 286_L 0.95 0.17
272_F 195_G 0.95 0.16
24_I 413_R 0.95 0.16
37_P 388_W 0.95 0.16
116_R 199_I 0.94 0.16
103_A 481_L 0.94 0.16
339_M 92_F 0.94 0.16
174_L 209_R 0.94 0.15
233_A 323_M 0.93 0.15
65_I 415_K 0.93 0.15
339_M 147_A 0.93 0.15
332_S 51_M 0.92 0.14
152_Q 340_V 0.92 0.14
25_S 303_P 0.92 0.14
124_V 205_W 0.92 0.14
52_S 79_T 0.92 0.14
204_T 120_R 0.91 0.13
77_R 86_N 0.90 0.13
147_F 298_H 0.90 0.13
149_F 201_A 0.89 0.13
87_Y 474_S 0.89 0.12
98_F 68_A 0.89 0.12
326_L 402_L 0.88 0.12
237_N 347_L 0.88 0.12
72_F 92_F 0.88 0.12
166_T 53_R 0.88 0.12
52_S 402_L 0.87 0.12
65_I 262_T 0.87 0.11
356_W 97_A 0.87 0.11
68_G 85_S 0.86 0.11
237_N 349_G 0.86 0.11
78_V 79_T 0.86 0.11
79_Y 85_S 0.85 0.11
50_I 221_A 0.85 0.11
299_F 413_R 0.85 0.10
59_G 192_Y 0.85 0.10
102_L 424_K 0.85 0.10
91_I 79_T 0.85 0.10
136_I 71_L 0.84 0.10
43_D 13_A 0.84 0.10
19_L 150_W 0.84 0.10
315_P 239_D 0.84 0.10
58_E 57_K 0.83 0.10
236_A 346_G 0.83 0.10
118_M 175_V 0.83 0.09
345_I 100_A 0.83 0.09
88_V 470_Q 0.83 0.09
69_G 74_E 0.83 0.09
183_Q 108_S 0.82 0.09
162_W 309_N 0.82 0.09
170_L 488_A 0.81 0.09
174_L 409_V 0.81 0.09
256_N 338_P 0.81 0.09
273_F 481_L 0.81 0.09
138_F 497_A 0.81 0.09
230_V 330_E 0.81 0.08
359_Y 10_W 0.81 0.08
269_L 205_W 0.80 0.08
36_L 30_I 0.80 0.08
109_K 198_F 0.80 0.08
36_L 111_V 0.80 0.08
255_M 347_L 0.79 0.08
152_Q 337_E 0.79 0.08
336_L 141_A 0.79 0.08
235_D 343_A 0.79 0.08
215_F 21_L 0.79 0.08
72_F 85_S 0.79 0.08
315_P 8_S 0.79 0.08
345_I 135_F 0.79 0.08
136_I 435_I 0.79 0.08
233_A 333_Q 0.79 0.08
137_A 62_N 0.78 0.08
339_M 88_V 0.78 0.07
229_F 347_L 0.78 0.07
360_K 455_D 0.78 0.07
170_L 10_W 0.78 0.07
62_V 108_S 0.78 0.07
204_T 189_M 0.78 0.07
191_K 389_S 0.78 0.07
254_W 239_D 0.78 0.07
46_R 217_L 0.78 0.07
353_Y 109_T 0.77 0.07
43_D 198_F 0.77 0.07
66_L 145_L 0.77 0.07
336_L 146_N 0.77 0.07
44_D 229_L 0.77 0.07
230_V 343_A 0.77 0.07
217_L 461_S 0.77 0.07
273_F 213_R 0.77 0.07
237_N 339_H 0.77 0.07
202_L 463_H 0.77 0.07
273_F 229_L 0.77 0.07
365_M 478_I 0.76 0.07
174_L 45_K 0.76 0.07
69_G 147_A 0.76 0.07
58_E 108_S 0.76 0.07
43_D 212_E 0.76 0.07
240_S 505_Q 0.76 0.07
236_A 335_N 0.76 0.07
345_I 457_L 0.76 0.07
286_R 124_Y 0.76 0.07
356_W 56_G 0.76 0.07
313_V 217_L 0.76 0.07
72_F 16_A 0.76 0.07
84_S 25_L 0.76 0.07
13_L 71_L 0.75 0.07
148_A 292_L 0.75 0.07
328_D 453_I 0.75 0.06
30_M 68_A 0.75 0.06
221_W 162_D 0.75 0.06
233_A 316_P 0.75 0.06
273_F 484_L 0.75 0.06
334_L 174_L 0.75 0.06
52_S 266_P 0.75 0.06
325_T 415_K 0.75 0.06
195_V 286_L 0.75 0.06
359_Y 213_R 0.75 0.06
310_F 235_L 0.75 0.06
354_T 216_A 0.75 0.06
351_L 111_V 0.75 0.06
152_Q 326_L 0.74 0.06
306_G 409_V 0.74 0.06
236_A 343_A 0.74 0.06
226_I 340_V 0.74 0.06
295_S 201_A 0.74 0.06
156_E 83_F 0.74 0.06
87_Y 80_N 0.74 0.06
338_I 98_M 0.74 0.06
147_F 45_K 0.74 0.06
276_L 278_D 0.73 0.06
349_I 71_L 0.73 0.06
362_W 288_I 0.73 0.06
359_Y 485_F 0.73 0.06
309_L 464_S 0.73 0.06
237_N 336_R 0.73 0.06
216_L 420_R 0.73 0.06
366_T 476_I 0.73 0.06
92_L 470_Q 0.73 0.06
87_Y 136_G 0.73 0.06
230_V 341_L 0.73 0.06
230_V 340_V 0.73 0.06
94_L 79_T 0.73 0.06
78_V 114_F 0.73 0.06
64_L 76_Q 0.73 0.06
266_I 232_I 0.73 0.06
167_P 480_G 0.73 0.06
353_Y 144_I 0.73 0.06
58_E 149_G 0.73 0.06
109_K 254_A 0.72 0.06
83_F 74_E 0.72 0.06
364_R 486_L 0.72 0.06
45_E 174_L 0.72 0.06
233_A 330_E 0.72 0.05
235_D 347_L 0.72 0.05
68_G 91_I 0.72 0.05
256_N 346_G 0.72 0.05
354_T 109_T 0.72 0.05
307_I 207_L 0.72 0.05
348_P 143_W 0.72 0.05
230_V 349_G 0.72 0.05
269_L 414_G 0.72 0.05
11_W 85_S 0.72 0.05
170_L 291_L 0.72 0.05
80_A 84_Y 0.72 0.05
339_M 85_S 0.72 0.05
236_A 377_R 0.71 0.05
226_I 338_P 0.71 0.05
237_N 345_R 0.71 0.05
352_L 428_W 0.71 0.05
65_I 424_K 0.71 0.05
342_I 71_L 0.71 0.05
217_L 384_A 0.71 0.05
54_G 110_F 0.71 0.05
198_L 301_D 0.71 0.05
15_I 343_A 0.71 0.05
204_T 50_D 0.71 0.05
174_L 401_L 0.71 0.05
92_L 420_R 0.71 0.05
209_L 316_P 0.71 0.05
103_A 157_A 0.71 0.05
101_P 455_D 0.71 0.05
233_A 346_G 0.71 0.05
328_D 120_R 0.71 0.05
23_M 71_L 0.71 0.05
230_V 377_R 0.70 0.05
126_G 102_M 0.70 0.05
366_T 139_L 0.70 0.05
138_F 114_F 0.70 0.05
78_V 33_L 0.70 0.05
331_S 203_S 0.70 0.05
81_A 120_R 0.70 0.05
188_L 416_I 0.70 0.05
230_V 346_G 0.70 0.05
111_A 420_R 0.70 0.05
65_I 100_A 0.70 0.05
239_P 340_V 0.70 0.05
166_T 476_I 0.70 0.05
120_D 478_I 0.70 0.05
196_I 486_L 0.70 0.05
227_D 341_L 0.70 0.05
236_A 505_Q 0.70 0.05
84_S 89_G 0.70 0.05
217_L 288_I 0.70 0.05
194_G 209_R 0.70 0.05
226_I 349_G 0.70 0.05
111_A 495_K 0.70 0.05
339_M 90_D 0.70 0.05
Legend: The i (protein A) and j (protein B) are positions as given in the UniProt sequences. The value of the raw score is the function of the learning procedure, L2 normalization and APC (entropic) correction.

Scaled Score = raw_score/average(raw_scores)
I_Prob = P(contact | scaled_score, seq/len, top_inter_score)

Text file of predictions
(includes both intra and inter preds)

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